才勇,副研究员

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个人简历:

19839月生,云南宣威人;20087月毕业于云南大学生物科学基地班,获理学学士学位,同年被保送到中国科学院兰州近代物理研究所硕博连读。20137月毕业于中国科学院兰州近代物理研究所,获理学博士学位。在学期间分别获得2005年优秀学生干部奖,2006年优秀学生奖,2013年中国科学院朱李月华奖和2013年中国科学院兰州近代物理研究所优秀毕业生称号。20139月至20188月受美国新泽西癌症研究委员会基金资助,于美国罗格斯大学新泽西癌症研究所做博士后研究。20189月至201912月,于美国罗格斯大学新泽西癌症研究所任助理研究员。20207月至今,于苏州大学放射医学与防护学院任副研究员。先后在Nucleic Acids ResearchOncogene Cell CycleRNA BiologyAm J Pathol等国际期刊发表文章10多篇,授权专利1项。

 

研究方向:

首次提出并证明辐射诱导G2期滑脱的生物学概念

辐射诱导细胞周期阻滞,触发依赖于p53信号通路的细胞衰老过程。细胞同步化结合高通量mRNA定量分析,我们发现长期阻滞的G2期细胞,其细胞周期依赖基因,在mRNA和蛋白水平与G1期细胞保持一致,然而细胞基因组仍然处于四倍体状态。由此,我们提出G2期滑脱(G2 slippage)的生物学概念。相应结果发表在Cell Cycle期刊(Ye C et al, Cell Cycle, 2013),由于其重要性,编委特邀辐射损伤领域的著名教授,沈志渊博士,写了一篇评论文章对其评述(Shen Z et al, Cell Cycle, 2013)。一年后,和我们类似的工作,作者命名为有丝分裂跳过(mitosis skip),发表于Molecular Cell期刊(Yoshikazu J et al, Mol Cell, 2014)。然而,到目前为止,都仅限于有丝分裂滑脱/有丝分裂跳过的表型描述,对于其产生的分子机理和生物学后果,都没有后续的研究,我们将基于CRISPR/CAS9的高通量筛选体系(敲除和过表达),深入研究参与有丝分裂滑脱的基因和信号通路,探讨其产生的分子机理。此外,很多癌前组织,经基因组检测,发现含有大量的四倍体细胞,而这些细胞都是处于长期的细胞周期阻滞状态,暗示有丝分裂滑脱参与了癌症的发生发展过程,对其开展深入研究,有助于开发新的肿瘤靶向药物。

 

BCCIP通过调节eIF6的核仁定位,从而调控核糖体大亚基60S的生物合成

BCCIP作为抑癌基因,可以维持基因组的稳定性。在脑部下调其表达,可诱发神经胶质瘤。而缺失BCCIP导致小鼠胚胎致死,暗示BCCIP是胚胎发育的必须基因。通过系统性的研究,我们发现BCCIP通过调节eIF6的核仁定位,影响核糖体RNA的成熟过程,进而调控核糖体大亚基60S的合成。相关工作经整理后,投到Nucleic Acids Research,得到评审专家一致好评,充分肯定相关工作的创新性和重要性,并很快被接收发表。在此研究中,我们还发现一个很重要的表型,就是在蛋白水平,BCCIPeIF6在癌症发生发展过程种的高度一致性,而和RPL23无关,这与之前的报道,BCCIP作为分子伴侣稳定RPL23并不一致(Wyler E et al, FEBS Letters, 2014),我们和罗格斯大学沈教授合作,继续深入研究BCCIP在肿瘤发生发展过程中的作用。

 

BCCIP参与DNA损伤修复,依赖于PARP1信号通路

BCCIP作为p21BRCA2相互作用蛋白,首次被报道于2001年,但是BCCIP如何参与DNA损伤修复,进而维持基因组的稳定,仍然不清楚。microirradiation诱导DNA损伤,在几秒内募集BCCIPDNA损伤位点。这个过程独立于ATMATRDNA-PKcs等激酶活性,而依赖于PARP1信号通路。免疫共沉降显示,BCCIP可以和Rad51相互作用,从而促进同源重组修复。BCCIP下调,增加有丝分裂后期染色体桥和UBF的产生,进而诱导基因组不稳定。

 

相分离参与DNA损伤修复的研究

相分离作为解释亚细胞无膜结构的形成机制,近年来引起越来越多科学家的关注。在DNA损伤领域,目前,仅有两篇文献(Kilic S et al, EMBO J, 2019; Pessina F et al, Nat Cell Bio, 2019)报道了53BP1具有相分离的特点,并参与DNA损伤修复。但是53BP1作为DNA损伤修复的下游效应因子,不能解释DSBs应答的早期阶段,和形成的DNA损伤foci。此外**叉的稳定性一直是DNA损伤修复核心问题。相分离如何参与DNA损伤foci的形成和**叉的稳定,没有相应的文献报道。我们的实验发现两个DNA损伤修复核心蛋白,分别参与DNA损伤foci的形成和**叉稳定。从已取得的初步实验结果看,其相分离的效应非常明确,我们将进一步检测其生物学功能。

 

代表性论著:

  1. Lu H, Ye C, et al. Requirement of Bccip for the Regeneration of Intestinal Progenitors. Am J Pathol. 2021 Jan;191(1):66-78.

  2. Ye C, et al. BCCIP is required for nucleolar recruitment of eIF6 and 12S pre-rRNA production during 60S ribosome biogenesis. Nucleic Acids Res, 2020 Dec 16;48(22):12817-12832.

  3. Lu H, Ye C, et al. Spontaneous development of hepatocellular carcinoma and B-cell leukemia in mosaic and heterozygous Bccip knockout mice. Am J Pathol. 2020 Mar 20

  4. Huhn S, Liu J, Ye C, et al. Regulation of spindle integrity and mitotic fidelity by BCCIP. Oncogene. 2017 Aug 17;36(33):4750-4766                               

  5. Zhang X, Ye C, Sun F, Wei W, Hu B, Wang J. Both Complexity and Location of DNA Damage Contribute to Cellular Senescence Induced by Ionizing Radiation. PLoS One. 2016 May 17;11(5)                                                 

  6. Hu W, Xu S, Yao B, Hong M, Wu X, Pei H, Chang L, Ding N, Gao X, Ye C, et al. MiR-663 inhibits radiation-induced bystander effects by targeting TGFB1 in a feedback mode. RNA Biol, 2014. 11(9), 1189-98                                         

  7. Ye C, Zhang Y, Wang J, Zhou G. Research on Cellular Senescence Induced by Heavy Ion. Nuclear Physics Review. 2014. 2(31), 201-209                            

  8. Bing Z, Yang G, Zhang Y, Wang F, Ye C, et al. Proteomic ****ysis of effects by x-rays and heavy ion in HeLa cells. Radiol Oncol, 2014. 48(2), 142-54                 

  9. Wang F, Bing Z, Zhang Y, Ao B, Zhang S, Ye C, et al. Quantitative proteomic ****ysis for radiation-induced cell cycle suspension in 92-1 melanoma cell line. J Radiat Res, 2013. Feb 26.                                                        

  10. Bing Z, Ao B, Zhang Y, Wang F, Ye C, et al. Warburg Effect due to Exposure to Different Types of Radiation. arXiv preprint arXiv:1303.2333, 2013                    

  11. Ye C, Zhang X, Wan J, Chang L, et al. Radiation-induced cellular senescence results from a slippage of long-term G 2 arrested cells into G 1 phase. Cell Cycle, 2013. 12(9), 1424-32

  12. Chang L, Hu W, Ye C, Yao B, Song L, Wu X, Ding N, Wang J, Zhou G. miR-3928 activates ATR pathway by targeting dicer. RNA Biology, 2012. 9(10), 1247-54.   

  13. He J, Li J, Ye C, Zhou L, Zhu J, Wang J, Mizota A, Furusawa Y, Zhou Gl. Cell cycle suspension: A novel process lurking in G2 arrest. Cell Cycle, 2011. 9(10), 1468-76